Blaualgen (Cyanobakterien) können Giftstoffe bilden, die Übelkeit, Erbrechen, Durchfall, Atemnot, Hautreizungen oder Quaddeln auf der Haut verursachen können. Hauptgrund für die Bildung von Blaualgen im Auensee ist ein hoher Nährstoffgehalt des Wassers. In „stehenden“ Gewässern begünstigen außerdem eine hohe Lichtintensität und hohe Wassertemperaturen deren Wachstum. Betroffene Gewässer weisen meist eine intensive grünliche bis bläuliche Pigmentierung auf. Zeitweilig erscheinen die Blaualgen auch als Schlieren oder Teppiche an der Wasseroberfläche.
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